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由单样本动态网络标志物检测亚博生物过程/疾病过程的临界状态及其关键分子研究获进展
时间:2019-03-27 浏览次数:708次
亚博生物: 中国科学院院刊

《中国科学院院刊》(中文版)是中国科学院主办的以战略与决议计划研讨为主的科技综...


2018年12月28日,世界学术期刊National Science Review 在线宣布了中国科学院亚博生物化学与细胞亚博生物学研讨所陈洛南研讨组题为Detection for disease tipping points by landscape dynamic network biomarkers 的最新研讨效果。该效果初次树立单样本“landscape”动态网络标志物(DNB: dynamic network biomarker)理论和办法,完成根据单个样本数据可检测亚博生物动态进程/疾病进程的临界状态及其要害分子。该理论结合单样本网络构建办法和动态网络标志物理论,提出针对单样本“landscape”的动态网络标志物检测办法,并使用该办法对癌症数据进行了剖析,不只成功地检测到疾病临界状态并且得到了三种癌症的DNB和“预后亚博生物标志物”。

在杂乱疾病的研讨中,疾病的前期预警或恶化的前期预警信号是杂乱疾病防备和医治重要的确诊目标,假如可以成功地量化疾病临界状态或捕获疾病的前期预警信号,对杂乱疾病的防备和医治有着深远含义。

根据这个问题,研讨人员使用动态网络标志物的概念并结合单样本网络构建办法,提出了在单样本水平上,对每个基因/分子进行系统性鉴别的“landscape”办法。该办法可以对单次采样的表达谱数据进行剖析,有用找到样本特异性的动态网络标志物,并检测其亚博生物动态进程的临界状态或疾病的前期预警信号。经过对癌症数据的剖析,研讨人员使用该办法成功找到了LUAD、THCA和KIRC三种癌症的DNB和“预后亚博生物标志物”。该效果也可应用于进化等杂乱非线性亚博生物进程的研讨。

生化与细胞所研讨员陈洛南与东京大学教授合原一幸为该文的一起通讯作者,山东大学研讨员刘小平缓安徽财经大学副教授常啸为论文的一起榜首作者,该研讨得到科技部、中科院和国家自然科学基金的经费支撑。

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由单样本动态网络标志物检测亚博生物进程/疾病进程的临界状态及其要害分子研讨获发展




(责任编辑:叶瑞优)
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